Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- i -

• i : ccf_point
• i0table : KaiserBessel , EMAN::Util::KaiserBessel
• I0table_maxerror() : KaiserBessel , EMAN::Util::KaiserBessel
• i0win() : EMAN::Util::KaiserBessel , EMAN::Util::FakeKaiserBessel , KaiserBessel , FakeKaiserBessel
• i0win_tab() : KaiserBessel , EMAN::Util::KaiserBessel
• I16 : EMAN::U3DWriter
• I2G : EMAN::EMConsts
• I3G : EMAN::EMConsts
• I4G : EMAN::EMConsts
• I5G : EMAN::EMConsts
• iarray : EMAN::EMObject
• iblp : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• ibsd : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• icend : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• icos_5_to_2() : EMAN::Transform
• icos_file : EMAN::IcosIO
• ICOS_SYM : EMAN::Transform3D
• IcosahedralSym() : EMAN::IcosahedralSym
• icosh : EMAN::IcosIO
• IcosIO() : EMAN::IcosIO
• icstart : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• id : EMAN::EmimIO::EmimImageHeader , ori_t
• identity() : EMAN::Matrix4 , EMAN::Matrix3
• iend : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• ifb : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• ifix() : EMAN::ChaoProjector
• ignore0 : EMAN::ImageAverager
• ihfl : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• ihist : EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
• im_diff() : EMAN::Util
• imag : EMAN::point_t , EMAN::EMData
• image : EMAN::ReconstructorVolumeData , EMAN::XYZReconstructor
• image0_copy : EMAN::CtfAverager
• image0_fft : EMAN::CtfAverager
• IMAGE_2D : EMAN::SpiderIO
• IMAGE_2D_FFT_EVEN : EMAN::SpiderIO
• IMAGE_2D_FFT_ODD : EMAN::SpiderIO
• IMAGE_3D : EMAN::SpiderIO
• IMAGE_3D_FFT_EVEN : EMAN::SpiderIO
• IMAGE_3D_FFT_ODD : EMAN::SpiderIO
• IMAGE_AMIRA : EMAN::EMUtil
• IMAGE_DATATYPE_TAG : EMAN::Gatan::TagTable
• IMAGE_DM3 : EMAN::EMUtil
• IMAGE_EM : EMAN::EMUtil
• IMAGE_EMIM : EMAN::EMUtil
• IMAGE_FITS : EMAN::EMUtil
• IMAGE_GATAN2 : EMAN::EMUtil
• IMAGE_HDF : EMAN::EMUtil
• IMAGE_HEIGHT_TAG : EMAN::Gatan::TagTable
• IMAGE_ICOS : EMAN::EMUtil
• image_idx : EMAN::FourierReconstructor
• IMAGE_IMAGIC : EMAN::EMUtil
• IMAGE_JPEG : EMAN::EMUtil
• IMAGE_LST : EMAN::EMUtil
• IMAGE_LSTFAST : EMAN::EMUtil
• IMAGE_MRC : EMAN::EMUtil
• image_mutation() : EMAN::Util
• IMAGE_PGM : EMAN::EMUtil
• IMAGE_PIF : EMAN::EMUtil
• IMAGE_PNG : EMAN::EMUtil
• IMAGE_SAL : EMAN::EMUtil
• image_scores : EMAN::ImageSort
• IMAGE_SINGLE_SPIDER : EMAN::EMUtil
• IMAGE_SPIDER : EMAN::EMUtil
• image_stack : EMAN::CUDA_Aligner
• image_stack_filtered : EMAN::CUDA_Aligner
• IMAGE_THUMB_INDEX_TAG : EMAN::Gatan::TagTable
• IMAGE_TIFF : EMAN::EMUtil
• IMAGE_UNKNOWN : EMAN::EMUtil
• IMAGE_V4L : EMAN::EMUtil
• IMAGE_VTK : EMAN::EMUtil
• IMAGE_WIDTH_TAG : EMAN::Gatan::TagTable
• IMAGE_XPLOR : EMAN::EMUtil
• ImageAverager() : EMAN::ImageAverager
• imageio : EMAN::LstFastIO , EMAN::LstIO
• imageio_cache : EMAN::GlobalCache
• imagenum : EMAN::PifIO::PifImageHeader
• images : EMAN::Analyzer
• ImageScore() : EMAN::ImageScore
• ImageSort() : EMAN::ImageSort
• ImageType : EMAN::EMUtil
• IMAGIC : EMAN::Transform3D
• IMAGIC_FFT_FLOAT_COMPLEX : EMAN::ImagicIO
• IMAGIC_FLOAT : EMAN::ImagicIO
• IMAGIC_FLOAT_COMPLEX : EMAN::ImagicIO
• IMAGIC_UCHAR : EMAN::ImagicIO
• IMAGIC_UNKNOWN_TYPE : EMAN::ImagicIO
• IMAGIC_USHORT : EMAN::ImagicIO
• imagich : EMAN::ImagicIO
• ImagicIO() : EMAN::ImagicIO
• IMG_EXT : EMAN::ImagicIO , EMAN::SalIO
• img_file : EMAN::ImagicIO
• img_filename : EMAN::ImagicIO
• img_index : EMAN::Gatan::TagTable
• imgnum : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader , EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
• imstr : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• imstw : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• in : EMAN::Gatan::TagData , EMAN::Gatan::TagGroup , EMAN::Gatan::TagEntry
• in_which_asym_unit() : EMAN::Symmetry3D
• index : EMAN::ImageScore , EMAN::Matrix3 , EMAN::Matrix4
• infomask() : EMAN::Util
• init() : EMAN::PlatonicSym , EMAN::Transform3D , EMAN::EMObject , EMAN::Factory< T > , EMAN::ImageIO , EMAN::FourierPixelInserter3D , EMAN::FourierInserter3DMode2 , EMAN::FourierInserter3DMode8 , EMAN::InterpolatedFRC , ctf_store
• init_gimx() : EMAN::Interp
• init_permissable_keys() : EMAN::Transform
• initialized : EMAN::AmiraIO , EMAN::DM3IO , EMAN::EmimIO , EMAN::EmIO , EMAN::FitsIO , EMAN::Gatan2IO , EMAN::IcosIO , EMAN::ImagicIO , EMAN::LstFastIO , EMAN::LstIO , EMAN::MrcIO , EMAN::PgmIO , EMAN::PifIO , EMAN::SalIO , EMAN::SpiderIO , EMAN::V4L2IO , EMAN::VtkIO , EMAN::XplorIO , EMAN::XYZIO
• InitializeVolumeData() : wustl_mm::SkeletonMaker::VolumeData
• inn : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• inner_radius : EMAN::CircularMaskProcessor
• inner_radius_square : EMAN::CircularMaskProcessor
• insert_buffed_slice() : EMAN::nn4_ctfReconstructor
• insert_clip() : EMAN::EMData
• insert_density_at() : EMAN::BaldwinWoolfordReconstructor
• insert_hollow_ellipse() : EMAN::TestTomoImage
• insert_image() : EMAN::CUDA_Aligner , EMAN::Analyzer , EMAN::KMeansAnalyzer , EMAN::SVDAnalyzer , EMAN::PCAsmall , EMAN::PCAlarge , EMAN::varimax
• insert_images_list() : EMAN::Analyzer , EMAN::SVDAnalyzer
• insert_padfft_slice() : EMAN::nn4Reconstructor , EMAN::nnSSNR_Reconstructor , EMAN::nn4_ctfReconstructor , EMAN::nnSSNR_ctfReconstructor
• insert_params() : EMAN::FactoryBase
• insert_pixel() : EMAN::BaldwinWoolfordReconstructor , EMAN::FourierPixelInserter3D , EMAN::FourierInserter3DMode1 , EMAN::FourierInserter3DMode2 , EMAN::FourierInserter3DMode3 , EMAN::FourierInserter3DMode4 , EMAN::FourierInserter3DMode5 , EMAN::FourierInserter3DMode6 , EMAN::FourierInserter3DMode7 , EMAN::FourierInserter3DMode8
• insert_rectangle() : EMAN::TestTomoImage
• insert_scaled_sum() : EMAN::EMData
• insert_slice() : EMAN::Reconstructor , EMAN::FourierReconstructorSimple2D , EMAN::FourierReconstructor , EMAN::BaldwinWoolfordReconstructor , EMAN::WienerFourierReconstructor , EMAN::BackProjectionReconstructor , EMAN::nn4Reconstructor , EMAN::nnSSNR_Reconstructor , EMAN::nn4_ctfReconstructor , EMAN::nnSSNR_ctfReconstructor , EMAN::XYZReconstructor
• insert_slice_weights() : EMAN::Reconstructor , EMAN::BaldwinWoolfordReconstructor
• insert_solid_ellipse() : EMAN::TestTomoImage
• inserter : EMAN::FourierReconstructor
• inside_region() : EMAN::Region
• instance : EMAN::Log , EMAN::GlobalCache
• Instance() : EMAN::Randnum
• InstanceType : EMAN::Factory< T >
• INT : EMAN::Gatan::TagData , EMAN::EMObject , EMAN::VtkIO
• int2str() : EMAN::Util
• INT_POINTER : EMAN::EMObject
• INTARRAY : EMAN::EMObject
• INTEGER_SIZE : EMAN::XplorIO
• intercept : EMAN::LinearRampProcessor
• interp_FRC_calculator : EMAN::FourierReconstructor
• interp_ft_3d() : EMAN::GaussFFTProjector
• interpolate() : EMAN::Quaternion
• InterpolatedFRC() : EMAN::InterpolatedFRC
• InterpolatedFRCMode1() : EMAN::InterpolatedFRCMode1
• InterpolatedFRCMode2() : EMAN::InterpolatedFRCMode2
• InterpolatedFRCMode3() : EMAN::InterpolatedFRCMode3
• InterpolatedFRCMode4() : EMAN::InterpolatedFRCMode4
• InterpolatedFRCMode5() : EMAN::InterpolatedFRCMode5
• InterpolatedFRCMode6() : EMAN::InterpolatedFRCMode6
• InterpolatedFRCMode7() : EMAN::InterpolatedFRCMode7
• InterpolationFunctoid() : EMAN::InterpolationFunctoid
• InterpolationFunctoidMode3() : EMAN::InterpolationFunctoidMode3
• InterpolationFunctoidMode4() : EMAN::InterpolationFunctoidMode4
• InterpolationFunctoidMode5() : EMAN::InterpolationFunctoidMode5
• InterpolationFunctoidMode6() : EMAN::InterpolationFunctoidMode6
• InterpolationFunctoidMode7() : EMAN::InterpolationFunctoidMode7
• IntPoint() : EMAN::IntPoint
• IntSize() : EMAN::IntSize
• inuse : EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
• inverse() : EMAN::Transform3D , EMAN::Matrix3 , EMAN::Matrix4 , EMAN::Transform , EMAN::Quaternion
• inverseUsingAngs() : EMAN::Transform3D
• invert() : EMAN::Transform
• IOMode : EMAN::ImageIO
• ip : EMAN::EMObject
• iphi : ori_t
• irec : EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
• is_big_endian : EMAN::PifIO , EMAN::SpiderIO , EMAN::AmiraIO , EMAN::Gatan::TagTable , EMAN::EmIO , EMAN::EmimIO , EMAN::IcosIO , EMAN::ImagicIO , EMAN::LstFastIO , EMAN::MrcIO , EMAN::DM3IO , EMAN::VtkIO , EMAN::LstIO , EMAN::XplorIO , EMAN::XYZIO , EMAN::FitsIO , EMAN::Gatan2IO , EMAN::PgmIO
• is_c_sym() : EMAN::CSym , EMAN::Symmetry3D
• is_complex : EMAN::CoordinateProcessor , EMAN::EMData
• is_complex_mode() : EMAN::ImageIO
• is_complex_type() : EMAN::EMUtil
• is_complex_x() : EMAN::EMData
• is_d_sym() : EMAN::Symmetry3D , EMAN::DSym
• is_data_big_endian() : EMAN::ByteOrder
• is_fftodd() : EMAN::EMData
• is_fftpadded() : EMAN::EMData
• is_FH() : EMAN::EMData
• is_file_exist() : EMAN::Util
• is_flipped() : EMAN::EMData
• is_float_big_endian() : EMAN::ByteOrder
• is_float_int() : EMAN::PifIO
• is_h_sym() : EMAN::Symmetry3D , EMAN::HSym
• is_host_big_endian() : EMAN::ByteOrder
• is_host_endian_checked : EMAN::ByteOrder
• is_identity() : EMAN::Transform , EMAN::Transform3D
• is_image_big_endian() : EMAN::ImageIO
• is_in_asym_unit() : EMAN::CSym , EMAN::TetrahedralSym , EMAN::PlatonicSym , EMAN::Symmetry3D , EMAN::HSym , EMAN::DSym
• is_local_maximum() : EMAN::BoxingTools
• is_new_file : EMAN::XplorIO , EMAN::EmIO , EMAN::IcosIO , EMAN::SpiderIO , EMAN::VtkIO , EMAN::FitsIO , EMAN::PifIO , EMAN::MrcIO
• is_new_hed : EMAN::ImagicIO
• is_new_img : EMAN::ImagicIO
• is_new_ver : EMAN::EmIO::EMHeader
• is_null() : EMAN::EMObject
• is_platonic_sym() : EMAN::Symmetry3D , EMAN::PlatonicSym
• is_real() : EMAN::EMData
• is_region_in_box() : EMAN::Region
• is_ri : EMAN::MrcIO , EMAN::EMData
• is_same_ctf() : EMAN::EMUtil
• is_same_size() : EMAN::EMUtil
• is_shuffled() : EMAN::EMData
• is_single_image_format() : EMAN::EmimIO , EMAN::LstIO , EMAN::PifIO , EMAN::ImagicIO , EMAN::SingleSpiderIO , EMAN::ImageIO , EMAN::SpiderIO , EMAN::LstFastIO
• is_tet_sym() : EMAN::TetrahedralSym , EMAN::Symmetry3D
• is_valid() : EMAN::MrcIO , EMAN::SpiderIO , EMAN::XYZIO , EMAN::AmiraIO , EMAN::CircularMaskProcessor , EMAN::EmimIO , EMAN::PgmIO , EMAN::DM3IO , EMAN::FitsIO , EMAN::ImagicIO , EMAN::EmIO , EMAN::CoordinateProcessor , EMAN::XplorIO , EMAN::Gatan2IO , EMAN::PifIO , EMAN::IcosIO , EMAN::V4L2IO , EMAN::SingleSpiderIO , EMAN::VtkIO , EMAN::LstFastIO , EMAN::LstIO , EMAN::SalIO
• is_valid_filename() : EMAN::EMUtil
• is_valid_spider() : EMAN::SingleSpiderIO , EMAN::SpiderIO
• is_validx() : EMAN::XYData
• isEmpty() : EMAN::PriorityQueue< ValueT, KeyT >
• isFeatureFace() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• isFull() : EMAN::PriorityQueue< ValueT, KeyT >
• isHelixEnd() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• iskip : APMDopt
• Isosurface() : EMAN::Isosurface
• ispg : EMAN::MrcIO::MrcHeader , EMAN::PifIO::PifImageHeader
• isPiercable() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• IsPower2() : EMAN::Util
• isSheetEnd() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• isSimple() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• istack : EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
• istart : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• istep : APMQopt
• ISYM : EMAN::Transform3D
• item_cache : EMAN::EMCache< T >
• IterationAverager() : EMAN::IterationAverager
• iterator() : EMAN::Dict::iterator
• iterator_category : EMAN::Dict::const_iterator , EMAN::Dict::iterator
• itht : ori_t
• ixold : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• iyold : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader