EMAN2 programs

• e2RCTboxer.py
• e2a2d_align.py
• e2a2d_average.py
• e2a2d_masks.py
• e2a2d_stat.py
• e2align2d.py
• e2align3d.py
• e2basis.py
• e2bdb.py
• e2boxadjust.py
• e2boxer.py
• e2boxer_old.py
• e2buildsets.py
• e2buildstacks.py
• e2classaverage.py
• e2classesbyref.py
• e2classextract.py
• e2classify.py
• e2classifycnn.py
• e2classifykmeans.py
• e2classifyligand.py
• e2classifytree.py
• e2classptcl.py
• e2classvsproj.py
• e2cmmtomrc.py
• e2cmpxplor.py
• e2compress.py
• e2ctf.py
• e2ctf2eman1.py
• e2ctf_auto.py
• e2ctffind3util.py
• e2ctfsim.py
• e2ddd_external.py
• e2ddd_movie.py
• e2ddd_particles.py
• e2display.py
• e2emx.py
• e2enrich.py
• e2eotest.py
• e2erasefiducials.py
• e2euler_refine.py
• e2eulerxplor.py
• e2evalimage.py
• e2evalparticles.py
• e2evalrefine.py
• e2extractsubparticles.py
• e2filtertool.py
• e2foldfitter.py
• e2fsc.py
• e2fsc_local.py
• e2fsc_real_local.py
• e2gmm.py
• e2gmm_analysis.py
• e2gmm_refine.py
• e2gmm_refine_new.py
• e2helixboxer.py
• e2help.py
• e2iminfo.py
• e2import.py
• e2initialmodel.py
• e2initialmodel_hisym.py
• e2initialmodel_sgd.py
• e2make3d.py
• e2make3dpar.py
• e2maskbyclass.py
• e2match.py
• e2motion.py
• e2msa.py
• e2parallel.py
• e2pathwalker.py
• e2pdb2mrc.py
• e2pdbviewer.py
• e2plotEulers.py
• e2proc2d.py
• e2proc2dmulti.py
• e2proc2dpar.py
• e2proc3d_huge.py
• e2procheader.py
• e2procjson.py
• e2proclst.py
• e2procpdb.py
• e2proctxt.py
• e2procxml.py
• e2project3d.py
• e2projectupdate21.py
• e2ptcltrace.py
• e2ptclvsmap.py
• e2rawdata.py
• e2rct.py
• e2refine.py
• e2refine2d.py
• e2refine2d_bispec.py
• e2refine_easy.py
• e2refine_postprocess.py
• e2refine_split.py
• e2refinefromfrealign.py
• e2refinemulti.py
• e2refinemultinoali.py
• e2refinetofrealign.py
• e2refinetorelion2d.py
• e2refinetorelion3d.py
• e2refinevariance.py
• e2relionsubsettoset.py
• e2reliontoeman.py
• e2runfrealign.py
• e2runresmap.py
• e2scannereval.py
• e2segment3d.py
• e2simmx.py
• e2simmx2stage.py
• e2simmxxplor.py
• e2skelpath.py
• e2spa_align.py
• e2spa_classify.py
• e2spa_make3d.py
• e2spa_refine.py
• e2spa_refine_multi.py
• e2spa_subframe.py
• e2sparxtoeman.py
• e2speedtest.py
• e2spt_align.py
• e2spt_align_subtlt.py
• e2spt_average.py
• e2spt_average_multi.py
• e2spt_binarytree.py
• e2spt_boxer.py
• e2spt_boxer_convnet.py
• e2spt_boxer_old.py
• e2spt_buildsets.py
• e2spt_classify.py
• e2spt_classify_byproj.py
• e2spt_ctf_old.py
• e2spt_eval.py
• e2spt_evalrefine.py
• e2spt_evalrefine_gui.py
• e2spt_evalsubtlt.py
• e2spt_extract.py
• e2spt_extractfromseg.py
• e2spt_fftamp.py
• e2spt_hac.py
• e2spt_intrafsc.py
• e2spt_isr.py
• e2spt_make3d.py
• e2spt_mapptclstotomo.py
• e2spt_pcasplit.py
• e2spt_preproc.py
• e2spt_project.py
• e2spt_recompute.py
• e2spt_refine.py
• e2spt_refine_new.py
• e2spt_refinemsa.py
• e2spt_refinemulti.py
• e2spt_refinemulti_new.py
• e2spt_refinemulti_noali.py
• e2spt_refinemulti_old.py
• e2spt_remake3dptcl.py
• e2spt_scramblestack.py
• e2spt_sgd.py
• e2spt_sgd_new.py
• e2spt_simulation.py
• e2spt_stat.py
• e2spt_structfac.py
• e2spt_subtilt_from_imod.py
• e2spt_subtilt_old.py
• e2spt_subtlt_local.py
• e2spt_tempmatch.py
• e2spt_tiltrefine.py
• e2spt_tiltrefine_oneiter.py
• e2spt_tiltstacker.py
• e2spt_tomoctf.py
• e2spt_trajfromrefine.py
• e2spt_wedge.py
• e2spt_wedgefill.py
• e2ssehunter.py
• e2ssematch.py
• e2stackanim.py
• e2stacksort.py
• e2symbest.py
• e2symsearch.py
• e2symsearch3d.py
• e2tilefile.py
• e2tileimage.py
• e2tiltseries.py
• e2tiltvalidate.py
• e2tomo_ctfraw.py
• e2tomo_drawcontour.py
• e2tomo_drawcurve.py
• e2tomo_eval.py
• e2tomo_icongpu.py
• e2tomo_mwfill.py
• e2tomo_showali.py
• e2tomo_stackframes.py
• e2tomo_tiltstacker.py
• e2tomogram.py
• e2tomopreproc.py
• e2tomoresolution.py
• e2tomoseg_buildtrainset.py
• e2tomoseg_convnet.py
• e2tomoseg_preproc.py
• e2tvrecon.py