Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- c -

• cache_au_planes() : EMAN::Symmetry3D
• cache_size : EMAN::Symmetry3D
• cached_au_planes : EMAN::Symmetry3D
• calc_amp1() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_amplitude() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_az_dist() : EMAN::EMData
• calc_bessel() : EMAN::Util
• calc_best_fft_size() : EMAN::Util
• calc_bilinear_least_square() : EMAN::Util
• calc_ccf() : EMAN::EMData
• calc_ccf_masked() : EMAN::EMData
• calc_ccfx() : EMAN::EMData
• calc_correlation() : EMAN::XYData
• calc_ctf1() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_dist() : EMAN::EMData
• calc_fast_sigma_image() : EMAN::EMData
• calc_flcf() : EMAN::EMData
• calc_g1() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_g2() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_gamma() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_helicity() : EMAN::PointArray
• calc_hist() : EMAN::EMData
• calc_lambda() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_least_square_fit() : EMAN::Util
• calc_locals() : EMAN::CircularMaskProcessor, EMAN::CoordinateProcessor, EMAN::MaskEdgeMeanProcessor, EMAN::MaskGaussInvProcessor, EMAN::MorphologicalProcessor, EMAN::RealPixelProcessor
• calc_mean() : EMAN::NormalizeCircleMeanProcessor, EMAN::NormalizeEdgeMeanProcessor, EMAN::NormalizeHistPeakProcessor, EMAN::NormalizeLREdgeMeanProcessor, EMAN::NormalizeMaxMinProcessor, EMAN::NormalizeProcessor, EMAN::NormalizeStdProcessor, EMAN::NormalizeUnitProcessor, EMAN::NormalizeUnitSumProcessor
• calc_mutual_correlation() : EMAN::EMData
• calc_noise() : EMAN::EMAN1Ctf, EMAN::EMAN2Ctf
• calc_radial_dist() : EMAN::EMData
• calc_ref_image_index() : EMAN::LstFastIO, EMAN::LstIO
• calc_sigma() : EMAN::NormalizeMaxMinProcessor, EMAN::NormalizeProcessor, EMAN::NormalizeUnitProcessor, EMAN::NormalizeUnitSumProcessor
• calc_snr() : EMAN::EMAN1Ctf
• calc_total_length() : EMAN::PointArray
• calc_transform() : EMAN::PointArray
• calcsigmamean : EMAN::KMeansAnalyzer
• calculate_min_max_vals() : EMAN::MarchingCubes
• calculate_surface() : EMAN::MarchingCubes
• camera_size : EMAN::Decoder
• camera_size_bits : EMAN::Decoder
• cb2sph() : EMAN::ChaoProjector
• cc : EMAN::MarchingCubes
• ccc : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
• ccc3d : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
• ccf : EMAN::CUDA_Aligner, EMAN::CUDA_multiref_aligner
• cconj() : EMAN::EMData
• cell_alpha : EMAN::XplorIO
• cell_beta : EMAN::XplorIO
• cell_gama : EMAN::XplorIO
• cella1 : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• cella2 : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• cellx : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• celly : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• cellz : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• center : EMAN::DiscritizeProcessor
• center_to_zero() : EMAN::PointArray
• centers : EMAN::KMeansAnalyzer
• centx : EMAN::PointArray
• centy : EMAN::PointArray
• centz : EMAN::PointArray
• chainId : EMAN::PDBReader
• change_filename_ext() : EMAN::Util
• changecount : EMAN::EMData
• CHAR : EMAN::Gatan::TagData, EMAN::GatanDM4::TagData, EMAN::VtkIO
• check_file_by_magic() : EMAN::Util
• check_image() : EMAN::TestUtil
• check_neighbors() : EMAN::TomoSeg
• check_read_access() : EMAN::ImageIO
• check_region() : EMAN::ImageIO
• check_swap() : EMAN::MrcIO
• check_write_access() : EMAN::ImageIO
• CircularAverageAnalyzer() : EMAN::CircularAverageAnalyzer
• CircularMaskProcessor() : EMAN::CircularMaskProcessor
• cit : EMAN::Symmetry3D
• ClampingProcessor() : EMAN::ClampingProcessor
• classify() : EMAN::BoxingTools
• classno : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
• CleanUpSkeleton() : wustl_mm::GraySkeletonCPP::VolumeSkeletonizer
• clear() : EMAN::CustomVector< type >, EMAN::Dict, EMAN::FourierIterReconstructor, EMAN::FourierReconstructor, EMAN::Reconstructor
• clear_min_max_vals() : EMAN::MarchingCubes
• clip_inplace() : EMAN::EMData
• ClipInplaceVariables() : EMAN::EMData::ClipInplaceVariables
• close_imageio() : EMAN::EMUtil
• cmap : EMAN::ColorRGBGenerator
• cmp() : EMAN::CccCmp, EMAN::Cmp, EMAN::DotCmp, EMAN::FRCCmp, EMAN::LodCmp, EMAN::OptSubCmp, EMAN::OptVarianceCmp, EMAN::PhaseCmp, EMAN::QuadMinDotCmp, EMAN::SqEuclideanCmp, EMAN::TomoCccCmp, EMAN::TomoFscCmp, EMAN::TomoWedgeCccCmp, EMAN::TomoWedgeFscCmp, EMAN::VerticalCmp, EMAN::XYZCmp
• CmpMode : EMAN::BoxingTools
• cmtotvar : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
• color_vertices() : EMAN::MarchingCubes
• colored_rectangle() : EMAN::GLUtil
• colormap : EMAN::ColorRGBGenerator
• colorMappingByClassSize() : EMAN::BoxSVDClassifier
• ColorRGBGenerator() : EMAN::ColorRGBGenerator
• colors : EMAN::BoxingTools
• column() : EMAN::Matrix3, EMAN::Matrix4
• comment : EMAN::EmIO::EMHeader
• common_lines() : EMAN::EMData
• common_lines_real() : EMAN::EMData
• complex : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D, EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• COMPLEX16_DATA : EMAN::Gatan::DataType, EMAN::GatanDM4::DataType
• COMPLEX8_DATA : EMAN::Gatan::DataType, EMAN::GatanDM4::DataType
• components26() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• components6() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• compute_1d() : EMAN::Ctf, EMAN::EMAN1Ctf, EMAN::EMAN2Ctf
• compute_1d_fromimage() : EMAN::Ctf, EMAN::EMAN1Ctf, EMAN::EMAN2Ctf
• compute_2d_complex() : EMAN::Ctf, EMAN::EMAN1Ctf, EMAN::EMAN2Ctf
• compute_2d_real() : EMAN::Ctf, EMAN::EMAN1Ctf, EMAN::EMAN2Ctf
• compute_missingwedge() : EMAN::EMData
• conj() : EMAN::Quaternion
• const_iterator() : EMAN::Dict::const_iterator
• construct_helix() : EMAN::PointArray
• contour_isosurface() : EMAN::GLUtil
• convolute() : EMAN::EMData
• ConvolutionProcessor() : EMAN::ConvolutionProcessor
• CoordinateProcessor() : EMAN::CoordinateProcessor
• coosmsa : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
• copy() : EMAN::PDBReader, EMAN::PointArray
• copy_exclude_keys() : EMAN::Dict
• copy_exclusive_keys() : EMAN::Dict
• copy_from() : EMAN::Ctf, EMAN::EMAN1Ctf, EMAN::EMAN2Ctf
• copy_keys_in() : EMAN::Dict
• copy_matrix_into_array() : EMAN::Transform
• copy_relevant_params() : EMAN::FactoryBase
• count : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D, EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
• count_stop : EMAN::PDBReader
• countExt() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• countInt() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• countIntEuler() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• create_inverse() : EMAN::Quaternion
• create_kernel() : EMAN::AreaProcessor, EMAN::LaplacianProcessor, EMAN::ZeroConstantProcessor
• create_processor_image() : EMAN::ImageProcessor
• create_radial_func() : EMAN::DoGFourierProcessor, EMAN::FourierAnlProcessor, EMAN::FourierProcessor, EMAN::HighpassAutoPeakProcessor, EMAN::LinearRampFourierProcessor, EMAN::LinearRampProcessor, EMAN::LoGFourierProcessor, EMAN::LowpassAutoBProcessor, EMAN::LowpassRandomPhaseProcessor, EMAN::MatchSFProcessor, EMAN::SetSFProcessor
• cross() : EMAN::Vec3< Type >
• cs : EMAN::Ctf
• CSym() : EMAN::CSym
• CTF : EMAN::CUDA_Aligner, EMAN::CUDA_multiref_aligner, EMAN::EMObject
• ctf : EMAN::Wiener2DFourierProcessor
• ctf2 : EMAN::point_t
• CTF_ : EMAN::Processor
• ctf_a0 : EMAN::PifIO::PifFileHeader
• ctf_a1 : EMAN::PifIO::PifFileHeader
• ctf_a2 : EMAN::PifIO::PifFileHeader
• ctf_a3 : EMAN::PifIO::PifFileHeader
• ctf_a4 : EMAN::PifIO::PifFileHeader
• ctf_a5 : EMAN::PifIO::PifFileHeader
• CTF_ABS : EMAN::Ctf
• CTF_ALIFILT : EMAN::Ctf
• CTF_AMP : EMAN::Ctf
• CTF_BACKGROUND : EMAN::Ctf
• CTF_FITREF : EMAN::Ctf
• CTF_INTEN : EMAN::Ctf
• CTF_MAGIC : EMAN::ImagicIO2, EMAN::ImagicIO, EMAN::MrcIO
• CTF_NOISERATIO : EMAN::Ctf
• ctf_params : EMAN::CUDA_multiref_aligner
• CTF_POWEVAL : EMAN::Ctf
• CTF_SIGN : EMAN::Ctf
• CTF_SNR : EMAN::Ctf
• CTF_SNR_SMOOTH : EMAN::Ctf
• CTF_TOTAL : EMAN::Ctf
• CTF_WIENER_FILTER : EMAN::Ctf
• CtfCAutoAverager() : EMAN::CtfCAutoAverager
• CtfCWautoAverager() : EMAN::CtfCWautoAverager
• ctfsum : EMAN::CtfWtAverager, EMAN::CtfWtFiltAverager
• CtfType : EMAN::Ctf
• CtfWtAverager() : EMAN::CtfWtAverager
• CtfWtFiltAverager() : EMAN::CtfWtFiltAverager
• CUDA_Aligner() : EMAN::CUDA_Aligner
• cuda_available() : EMAN::EMUtil
• CUDA_multiref_aligner() : EMAN::CUDA_multiref_aligner
• cur : EMAN::BitStream< T >, wustl_mm::SkeletonMaker::GridQueue2
• cur_h : EMAN::SpiderIO
• curveRadius : wustl_mm::GraySkeletonCPP::VolumeSkeletonizer
• curveSkeleton() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• curveSkeleton2D() : wustl_mm::SkeletonMaker::Volume
• CustomVector() : EMAN::CustomVector< type >
• cut_slice() : EMAN::EMData