- s -
- scale : EMAN::LinearXformProcessor, EMAN::OmapIO::OmapHeader, EMAN::OptVarianceCmp, EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
- scale2 : EMAN::OmapIO::OmapHeader
- scale_fac : EMAN::PifIO::PifFileHeader
- scalefactor : EMAN::PifIO::PifFileHeader
- scan_mode : EMAN::SalIO
- scannum : EMAN::PifIO::PifImageHeader
- score : EMAN::ImageScore, wustl_mm::SkeletonMaker::gridQueueEle
- sec : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D, EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
- SECTION_MODE : EMAN::XplorIO
- segid : EMAN::TomoObject
- serh : EMAN::SerIO
- SeriesID : EMAN::SerIO::SerHeader
- SeriesVersion : EMAN::SerIO::SerHeader
- shift : EMAN::LinearXformProcessor, EMAN::OptVarianceCmp
- SHORT_CTF_MAGIC : EMAN::MrcIO
- si : EMAN::EMObject
- sigma : EMAN::CoordinateProcessor, EMAN::ImagicIO2::Imagic4D, EMAN::ImagicIO::ImagicHeader, EMAN::LoGFourierProcessor, EMAN::MorphologicalProcessor, EMAN::PifIO::PifImageHeader, EMAN::RealPixelProcessor, EMAN::SpiderIO::SpiderHeader
- sigma1 : EMAN::DoGFourierProcessor
- sigma2 : EMAN::DoGFourierProcessor
- sigma_image : EMAN::ImageAverager
- sinoend : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
- sinostart : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
- SITUS_HEADER_LINES : EMAN::SitusIO
- size : EMAN::CustomVector< type >, EMAN::Region
- skeletonDirectionRadius : wustl_mm::GraySkeletonCPP::VolumeSkeletonizer
- skelmap : EMAN::TomoSeg
- slice_value : EMAN::MaskGaussInvProcessor
- slices : EMAN::RealMedianReconstructor
- slope : EMAN::LinearRampProcessor
- slowseed : EMAN::KMeansAnalyzer
- snr : EMAN::EMAN2Ctf
- snrsum : EMAN::CtfCAutoAverager, EMAN::CtfCWautoAverager
- spaberr : EMAN::ImagicIO2::Imagic4D
- space : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
- space2 : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
- space3 : EMAN::ImagicIO::ImagicHeader
- spacingx : EMAN::VtkIO
- spacingy : EMAN::VtkIO
- spacingz : EMAN::VtkIO
- SPECULAR_COLOR_COUNT : EMAN::U3DWriter
- stack_size : EMAN::MrcIO
- stamp : EMAN::IcosIO::IcosHeader
- stamp1 : EMAN::IcosIO::IcosHeader
- stamp2 : EMAN::IcosIO::IcosHeader
- stamp3 : EMAN::IcosIO::IcosHeader
- start : EMAN::PawelProjector::IPCube
- STEP : EMAN::CUDA_Aligner, EMAN::CUDA_multiref_aligner
- step : EMAN::DiscritizeProcessor
- str : EMAN::EMObject
- strarray : EMAN::EMObject
- sub : EMAN::MrcIO::FeiMrcHeader
- subnx : EMAN::ReconstructorVolumeData
- subny : EMAN::ReconstructorVolumeData
- subnz : EMAN::ReconstructorVolumeData
- subx0 : EMAN::FourierPixelInserter3D, EMAN::ReconstructorVolumeData
- suby0 : EMAN::FourierPixelInserter3D, EMAN::ReconstructorVolumeData
- subz0 : EMAN::FourierPixelInserter3D, EMAN::ReconstructorVolumeData
- sum : EMAN::AmpweightFourierProcessor, EMAN::SNREvalProcessor
- supp : EMAN::EMData
- surfaceRadius : wustl_mm::GraySkeletonCPP::VolumeSkeletonizer